Dr. Biswas Dr. Pradip Biswas, 物理学助理教授, 是否建立了一个计算生物物理学和生物工程小组来进行生物分子建模, 发展的修女, 经典和多尺度分子动力学模拟, and docking. 目的是研究蛋白质的反应机制和过渡状态,并从分子水平理解蛋白质在聚合物表面的吸附.

目前正在进行的项目有:

  1. 通过对iNOS的多尺度量子力学-分子力学(QMMM)研究,阐明四氢生物terin和l-精氨酸在一氧化氮(NO)合成反应机制中的作用. 一氧化氮合酶系统的解耦与高血压的发生有关. 阐明这一机制将有助于理解疾病状态与正常血压的NOS系统. 这个项目是与博士合作的. 俄亥俄州克利夫兰州立大学的Valentin Gogonea说.
  2. 在CHARMM(哈佛分子力学化学)开发多相模拟协议,用于同时使用固相聚合物和液相蛋白质的专用力场,并进行模拟,以了解吸附蛋白质上的构象和功能变化. 这个项目是与博士合作的. 南卡罗来纳州克莱姆森大学的罗伯特·拉图尔说.
  3. 钙结合蛋白(CaBP)在乳腺癌中破坏雌激素-雌激素受体(ER)-CaM复合物与DNA的结合从而阻止ER- α依赖转录中的作用的研究. 这个项目是与博士合作的. Rajnarayanan.
  4. 提出了一种ab-initio型经典力场,以消除参数的适宜性(使其与拓扑无关)和极化问题.

For simulations, Dr. Biswas已经建立了一个小型的集群,其中有四个四核机架服务器和一个主服务器,并且正在购买另一个六核机架服务器, summer, 2009年秋季还会增加, 2009. 这些服务器将被安置在信息技术部门.

在这个项目中工作的本科生目前共享物理实验室的空间. 一个专门的计算机集群室,以适当的维护集群和专门的本科生工作空间与适当的计算机设施,将有助于计划和正在进行的比斯瓦斯小组的研究. 两位新近接受物理研究训练的本科生已被研究生院录取.

Contact Information

Pradip Biswas, Ph.D.
物理学助理教授
  
  pbiswas@cnshoescity.com